鸦片战争前夕，陈澧积极提出设险以防、水师与水勇并重的反侵略战略思想；主张“中国兵强，乃能驱策四夷”。他曾写下了《虎门观潮》、《得藕江书却寄》和《炮子谣》等爱国诗篇。

　　1857年12月，英法联军攻陷广州，他举家避难南海县横沙村，还协助当地办团练御外侮。3年后侵略军退走，他即返广州修葺被战火所毁的学海堂，邀请了张维屏、梁廷楠、谭莹、金锡龄、李应田等众多学者名流，举行复课典礼，并各赋诗为记，陈澧赋诗云　：半天霞彩拥层峦，晓踏虚堂雨乍干。战后山余芳草碧，春来花似酒颜丹。去年此日乡愁黑，万紫千红泪眼看。难得故林无恙在，莫辞沉醉共凭栏。

读书无不有批评点校

　　陈澧东塾藏书，四部悉备，无不有批评点校，所书评语，或朱或墨，皆庄重不苟。至民国，东塾遗书中的稿本及评校本多为时任广东省立图书馆馆长徐信符先生的南州书楼所得。徐信符先生记载“观其(陈澧)手稿，又可知其治学方法，凡阅一书，继分某章、某句、某字，连缀为一，然后下以己见，评其得失，如司法官搜集证据，然后据以定案”。此方法上承司马光之治《通鉴》，下启陈垣先生之治历史，实是一脉。